NanoBRET?和NanoBiT^?兩種系統均可實現對蛋白相互作用的實時測定。NanoBRET? PPI檢測系統的工作原理是利用兩種靶蛋白在細胞中進行表達并發生相互作用時，NanoLuc^?-蛋白A融合蛋白（能量供體）和熒光標記的Halo-Tag^?-蛋白B融合蛋白（能量受體）之間發生的能量轉移。來自NanoLuc^?供體的明亮藍移信號與遠紅移HaloTag^?受體的結合可實現對蛋白質相互作用的檢測，并且相較于傳統BRET檢測系統，該檢測系統可產生最佳的光譜重疊、可增強信號以及產生較低的背景信號。
NanoBRET?和NanoBiT^? PPI檢測系統具有下述應用：
?對活細胞內的蛋白質相互作用動力學進行分析；
?測定單個時間點的蛋白相互作用或進行實時動力學分析；
?使用全長蛋白或相關結構域分析蛋白相互作用；
?使用基于轉染的方法引入蛋白融合體；
?將檢測擴展為高通量檢測模式。